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利用多起始位点进行染色体复制已在多株古菌中得到了发现，但是对于古菌多复制起始位点的协调利用了解地还比较少。在西班牙盐盒菌中，通过基因敲除、自主复制能力测试及基于芯片的MFA技术，我们发现复制起始位点的起始特异依赖于其邻近的Cdc6起始蛋白，并且染色体上至少保留有一个起始位点才能满足其复制的要求。对于染色体上的两个复制起始位点，我们发现其起始活性具有不同的调控方式：oriC1内一对富含G的反向重复序列可增强其起始活性，而oriC2下游的富含ORB的区域由于可结合Cdc6E从而减弱其起始活性。