【摘 要】
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本研究对1株H5N1亚型禽流感病毒(AIV)Chicken/Jilin/9/(H5N1)(JL9/04)进行了全病毒基因组序列测定和分析.结果表明,所扩增到的8个片段均包括相应的病毒基因的完整开放阅读框
【机 构】
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军事医学科学院军事兽医研究所(长春)
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本研究对1株H5N1亚型禽流感病毒(AIV)Chicken/Jilin/9/(H5N1)(JL9/04)进行了全病毒基因组序列测定和分析.结果表明,所扩增到的8个片段均包括相应的病毒基因的完整开放阅读框架.通过序列分析,就整体而言,JL9/94株与广东分离株A/chicken/Guangdong/174/04(H5N1)(GD4/04)及香港分离株A/Goose/Hong Kong/3014.8/2000(HTN1)(HK8/00)的同源性较高;而与广东分离株A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)(GD1/96)及香港分离株A/Hong Kong/156/97(HK156.07)的同源性较低.JL9/04株与其余各株HA的核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性差异均较小(97.2﹪~98.8﹪,96.3﹪~98.4﹪).JL9/04株在HA切割位点处的6个连续碱性氨基酸残基序列为RRRKKR↓GLF,符合AIV强毒株HA基因裂解位点的分子模式.JL9/04株在HA上的6个糖基化位点、2个受体结合位点与参照毒株完全一致,表明这几个毒株HA基因亲缘关系极为密切,且具有相似的生物学特性.JL9/04株与欧亚种系代表株A/Turkey/Ireland/1378/83(Ire/83)的HA同源率为86.9﹪,而与北美种系代表株A/chicken/Penn/1/83(PA/83)同源率仅为77.4﹪,表明该毒株起源于欧亚种系.就NA而言,JL9/04株与GD4/04株的同源性最高(97.9﹪,98.9﹪),与HK156/97株的同源性最低(87.1﹪,90.7﹪).香港流感病毒分离株HK156/97的NA缺失57个核苷酸(19个氨基酸)残基,而JL9/04株、GD4/04株以及泰国分离株TL/04的NA均缺失60个核苷酸(20个氨基酸)残基,缺失位置与HK156/97株相比较向5′端移动了5个氨基酸残基.
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