【摘 要】
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采用兼并引物PCR技术,从红鲫基因组DNA中克隆和测序了Sox基因的7个HMG盒区序列,分别命名为Sox1-1、Sox1-2、Sox1-3、Sox9、Sox11b1-1、Sox11b1-2和Sox11b2.Sox11b1-1和Sox11b
【机 构】
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南华大学生命科学与技术学院,湖南,衡阳,421001
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采用兼并引物PCR技术,从红鲫基因组DNA中克隆和测序了Sox基因的7个HMG盒区序列,分别命名为Sox1-1、Sox1-2、Sox1-3、Sox9、Sox11b1-1、Sox11b1-2和Sox11b2.Sox11b1-1和Sox11b1-2是红鲫Sox11b1的等位基因,编码相同的氨基酸序列,与斑马鱼Sox11b的氨基酸同源性为100％;在系统进化树中,红鲫2个Sox11b亚型(Sox11b1和Sox11b2)与斑马鱼Sox11b聚在一起,而远离斑马鱼Sox11a.红鲫Sox1的3个等位基因(即Sox1-1、Sox1-2和Sox1-3)编码相同的氨基酸序列,与斑马鱼Sox1a的氨基酸同源性为100％.然而,在核苷酸水平,红鲫Sox1-1与斑马鱼Sox1a的同源性为96.1％;Sox1-2和Sox1-3与斑马鱼Sox1b的同源性分别为95.1％和95.5％.聚类分析显示,红鲫Sox1-1与斑马鱼Sox1a聚在一起,Sox1-2和Sox1-3与斑马鱼Sox1b聚在一起.结果表明,Sox1基因在红鲫的进化过程中已经发生复制,但可能没有分化为两个平行同源基因.
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