【摘 要】
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F1-ATPase 是三磷酸腺苷(ATP)合成酶的一种.F1-ATPase 是一类跨膜蛋白,在真核细胞中存在于线粒体的内膜中,该蛋白通过F0 功能域锚定在细胞内膜中.F1-ATPase 是生命体中化
【机 构】
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北京理工大学宇航学院生物力学与生物材料实验室,北京 100081
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F1-ATPase 是三磷酸腺苷(ATP)合成酶的一种.F1-ATPase 是一类跨膜蛋白,在真核细胞中存在于线粒体的内膜中,该蛋白通过F0 功能域锚定在细胞内膜中.F1-ATPase 是生命体中化学能与机械能相互转化的基本单元,其转化效率甚至可以达到100％.F1-ATPase 由7个功能域构成,其中3 个α 功能域和3 个β 功能域交错排列形成环形结构,该环形结构中间的是γ 功能域.F1-ATPase 利用膜内外质子的浓度差作为能量源,可将二磷酸腺苷(ADP)与磷酸合成为ATP；当ATP 发生水解时,F1-ATPase 的β 功能域发生构型变化,从而推动γ 功能域的旋转,实现化学能到机械能的转化.由此可见,F1-ATPase 的功能与β 功能域的构型变化密切相关.在本文工作中,我们将以F1-ATPase 的β功能域为研究对象,采用双势阱力场构建蛋白质分子的粗粒化模型.我们采用该粗粒化模型,模拟了该系统蛋白质分子长时间尺度的动力学特性,并研究了配体分子(ATP 分子)与蛋白质分子的结合过程.
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