目的:比较不同食性猪肠道细菌群落结构及多样性。方法:对每种猪收集12个不同个体的粪便样品,等量混合后,每样品取三个平行样,提取总DNA,PCR扩增,获得16S rRNAV1-V3标签片段;高通量测序,根据序列的相似性,将序列归为多个0TU;Shannon-Wiener曲线、Rank_Abuance Curve、venn图分析并比较菌群结构及多样性。结果:不同食性之间肠道菌群差异较大。肠道菌群均以厚壁菌门、拟杆菌门、以及变形菌门为主,但的厚壁菌门显著减少,而变形菌门显著增加。从食草猪肠道菌群种属丰富度及Shannon指数均显著高于外三元。结论不同食性肠道菌群存在显著差异。与外三元相比,黑香猪、巴马香猪肠道微生物组最相近,消化纤维的细菌构成合理,几种乳酸菌在外三元,巴马香猪肠道大量存在,而黑香猪中没有。证明了猪的不同饲养特性与肠道菌群密切相关。巴马香猪环境细菌较多,肠道存在大量嗜低温弓形杆菌;外三元与人的肠道细菌类型更接近。