吉木萨尔凹陷二叠系芦草沟组从沉积至今经历了晚海西、印支、燕山、喜马拉雅等多期次构造运动，初始沉积地层在地史演化过程中的展布形态遭到多期次改变，关键成藏期的地层展布形态同样受到后期构造运动的改造，使已形成的油气藏存在相应期次的破坏—再运移聚集的调整，因此有必要进行构造与沉积演化方面的工作，分析不同期次构造运动对芦草沟组的沉积建造与改造作用，有助于进一步研究芦草沟组源储一体的油气聚集规律。本文采用断层落差法，分析了不同时期边界断裂的活动性；应用旋转法编制了吉木萨尔凹陷垂直主要构造线的构造演化剖面，分析了凹陷的构造演化特征；以此为基础，结合区域构造背景，将吉木萨尔凹陷二叠系芦草沟组的构造沉积演化划分为4 个阶段：二叠纪前陆盆地发育—芦草沟组初始地层沉积阶段，三叠纪陆内坳陷发育—芦草沟组持续沉降、向东向北掀斜改造阶段，侏罗纪—白垩纪陆内坳陷发育—芦草沟组差异升降、振荡改造成型阶段，古近纪—第四纪类前陆盆地发育—芦草沟组楔状埋深加大阶段。