【摘 要】
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柞蚕核型多角体病毒(Antheraea pernyi nucleopolyhedroviruses,AnpeNPVs)会到引起柞蚕爆发大面积的柞蚕脓病。之前,核型多角体病毒的比较基因组学研究都集中在不同物种间的
【机 构】
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重庆师范大学生命科学学院; 西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室;
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柞蚕核型多角体病毒(Antheraea pernyi nucleopolyhedroviruses,AnpeNPVs)会到引起柞蚕爆发大面积的柞蚕脓病。之前,核型多角体病毒的比较基因组学研究都集中在不同物种间的基因结构,而传多样性研究则相对较少。为了研究AnpeNPVs不同地理株系间的遗传多样性,我们测序了一株从中国河南省分离的柞蚕NPV(Anpe NPV-H)基因组,并和之前从辽宁省分离的两株柞蚕NPV(AnpeNPV-L和AnpeNPV-Z)进行了比较基因组学分析。AnpeNPV-H的全基因组大小为125,605bp,共预测了146个开放阅读框(ORF),包括95个功能注释蛋白和51个假定蛋白。我们发现7个假定蛋白在三株AnpeNPVs间存在差异,其余的基因组成则非常相似。在三株AnpeNPVs间,共鉴定超过200个单核苷酸多态性(SNP),其中85%位于蛋白编码区。同时,odv-e56,P94-like,和egt三个基因的非同义突变较高,表明这三个编码蛋白基因可能经历了正向选择或纯化选择。我们发现在三株AnpeNPVs间一些基因的氨基酸发生变异,例如编码膜蛋白的基因、抑制凋亡和蜕皮的基因和与DNA复制相关的DNA聚合酶和解旋酶等基因。最后,我展示了三株AnpeNPVs间遗传重组的证据。本研究揭示了AnpeNPVs种内水平的变异和株系内基因组的动态结构。
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