猫细小病毒CC-1株NS1全基因的克隆及序列分析

来源 :中国北方第六届实验动物科技年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jyy3196294
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本实验室从长春地区送检的猫脾脏中分离保存的一株猫细小病毒,命名为CC-1株,对此毒株提取病毒基因组DNA,根据Genbank中收录的猫细小病毒(CU-4株)基因组,设计一对包含NS1全基因的PCR引物,对其基因进行整体扩增。将扩增产物提纯后克降入pMD18-T载体,通过酶切、PCR和测序进行验证。结果表明,该毒株NS1基因序列长度约为2.35kb,该基因的阅读框总长为2007bp,编码668个氨基酸组成的多肽。该序列与FPV193/70株、PLI-IV株、TU-2株、CU-4株、94-1株和XJ-1株的NS1基因比较,核苷酸的同源性分别为99.0%、98.9%、98.8%、98.7%、98.6%、99.4%,氨基酸的同源性分别为98.8%、98.7%、98.5%、98.7%、98.5%、99.3%。该毒株与CPV、MEM、RPV、PPV、GPV、MVM NS1的进化树分析表明,它与MEM和CPV的亲缘关系比较近,与PPV的亲缘关系较远。
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