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为研究ITS2序列对北豆根及其混伪品山豆根和近缘物种的鉴别能力,本文选用了来自不同产地的北豆根及其混伪品共45份药材样品,进行植物基因组DNA提取,PCR扩增,双向测序后对数据进行CodonCode Aligner和MEGA5.0软件处理。数据显示,不同产地北豆根ITS2序列种内高度保守,与混伪品的种间变异较大,其种内遗传距离远小于种间距离;NJ树结果显示北豆根所有样品均聚为一支,与其混伪品可明显区分。此外,ITS2的二级结构也可作为鉴定北豆根药材及混伪品和近缘种的一个方法。结论:ITS2序列可作为鉴定北豆根药材及混伪品及近缘种的一段标准序列,具有重要的应用价值。