PCR-DGGE技术分析罗非鱼肠道种群结构及多样性

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研究罗非鱼肠道菌群结构与多样性,对探讨罗非鱼肠道菌群的平衡,筛选肠道益生菌、了解其发病原因以及防治等工作有重要意义。运用PCR—DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)技术对水产市场上常见罗非鱼养殖品种尼罗罗非鱼和红罗非鱼的肠道微生物菌群结构进行研究。通过提取肠道DNA,PCR扩增细菌16S rDNA基因V3可变区,用DGGE方法检测PCR产物,分析肠道菌群系统发育树。从DGGE图谱分析结果表明,罗非鱼肠道菌群丰富度较高,不同种罗非鱼肠道菌群有较高相似度(0.59-0.85),同种罗非鱼肠道的前、中、后肠也有较高相似度(0.59-0.79)。实验证明PCR-DGGE是一种快速而有效分析肠道微生物菌群的技术。肠道菌群结构及多性分析为筛选罗非鱼肠道益生菌提供了必要的信息。
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