目的：分析厦门市思明区流动人口结核病防治效果。方法：实施第五轮全球基金结核病项目流动人口结核病防治项目，初诊病人、肺结核病人登记本、非结防机构网络直报病人的到位、追踪及核实登记本上注明户籍地址、标明流动人口，核对、统计各登记本和项目报表的信息数据，按照国家“五率”要求或与户籍人口工作质量指标进行比较。结果：流动人口新发涂阳任务完成率111.98％，报告率、转诊率都达到国家大于等于95％的要求；追踪到位率70.3％，高于全国平均水平(48.3％)；总体到位率78.3％也高于全国平均水平(70.8％)；2009年涂阳病人系统管理率为91.67％，与户籍人口无显著性差异。结论：思明区流动人口结核病防治效果良好，但流动人口防治效果仍比户籍人口差。流动人口防治效果受诸多不确定因素的影响，在考核、评价不同县区结核病防治效果时，宜将流动人口与户籍人口分开考核评价。