我国知识产权行政保护制度是伴随着中国现代知识产权制度的产生而建立起来的，而我国的知识产权行政保护制度的产生是与我国的传统文化和国情分不开的。行政权力以法律的形式深度介入知识产权私权制度的运行，成为我国知识产权保护制度的一项特色。行政权力的介入，的确带来了不错的效果，这一模式也被其他国家借鉴和采纳。但是，这一模式也受到了一些质疑，行政权力干涉司法权力的事实遭到了来自不同方面群体的非议。知识产权行政保护制度实际上是我国特有的一项科技政策，厘清它、把握好它，对我国的知识产权制度的发展和实施效果来说具有重大意义。本文试图从历史根源、传统文化、现实条件出发，结合相关法律法规，通过深入的理论分析来说明该制度形成的必然性，呈现未来中国知识产权行政保护制度的发展趋势，探究适合中国国情的知识产权行政保护模式和措施。