【摘 要】
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为了解鸭坦布苏病毒安徽分离株AH-F10的分子特征及构建该病毒的感染性克隆,本文利用RT-PCR方法对其全基因组序列进行了测定,并将全基因组及其推导的氨基酸序列与参考毒株进行
【机 构】
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安徽农业大学动物科技学院; 中国农业科学院上海兽医研究所; 安徽动物疫病疾控中心;
【基金项目】
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安徽省年度重点科研项目(11070303024);安徽省教育厅重点科研项目(KJ2012A124);公益性农业科研专项(201003012,0080319);“863”计划(2011AA10A200)
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为了解鸭坦布苏病毒安徽分离株AH-F10的分子特征及构建该病毒的感染性克隆,本文利用RT-PCR方法对其全基因组序列进行了测定,并将全基因组及其推导的氨基酸序列与参考毒株进行序列比对及系统进化分析。结果表明,AH-F10株的全基因组序列长10,990nt,含有一个大的阅读框架,两侧各有一个非编码区(Untranslationregion,UTR)。序列比对结果表明,AH-F10株与13株参考毒株的基因编码区具有较高的氨基酸序列同源性。其中,与JS2010株的同源性最高,达98%,提示安徽和江苏省流行的鸭坦布苏病毒可能来自同一祖先。相比之下,鸭坦布苏病毒的5’UTR的序列表现一定程度的变异,AH-F10株与参考株的核苷酸序列同源性在94%-97%之间。本文研究结果为了解鸭坦布苏病毒的遗传变异及构建该病毒的反向遗传学操作系统奠定了基础。
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