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目的:了解南方河网型水源中隐孢子虫的种类及其污染来源。方法:于2009年8-10月对22份河水进行调查，应用PCR技术检测其中隐孢子虫。结果:7份河水呈隐孢子虫PCR扩增阳性，含有5种隐孢子虫种类/基因型，包含有仅感染动物型，也包含人兽共患型。结论:该地区河水中受到隐孢子虫污染，畜禽场废水为主要污染来源。