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本文通过计算机模拟分析BC1 设计中标记密度（标记间隔5cM、10cM、20cM、 50cM）对QTL 定位精确性的影响，以均方误（MSE）为衡量指标。结果表明，当遗传图谱上相邻标记间的图距在5cM 以上时，提高标记密度，对于提高QTL 定位的准确性和精确性具有积极的效应，但当标记密度达到某一程度（相邻标记间图距为2cM）时，由于方法本身的局限，继续增加标记密度，对标记-QTL 连锁分析法定位QTL 的效果则没有实际意义。标记密度对检验统计量LOD 值的影响则不明显。