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新一代高通量测序技术的发展，推动了很多相关研究领域的发展。国际上很多研究机构正在研究利用高通量测序数据进行微生物检测的算法，目前已有一些基于高通量测序数据的微生物检测算法流程设计成功并发布出来。该文调研了利用高通量测序数据进行微生物检测的相关文献，研究了已发布的基于高通量测序数据的微生物检测算法的功能和实现流程，分析了几个有代表性算法的优点和不足。最后，对这些检测算法的设计思路进行了总结和分类，提出了基于高通量测序数据的微生物检测算法的改进设想。