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黑脸琵鹭在兴化湾的南迁、越冬和北迁时间具有明显的规律性。昼间行为大致分为休息、觅食、维护、位移、站立、玩耍和社会行为7种，其中休息时间占比为75.56％，休息行为主要发生在10：00～15：00间。黑脸琵鹭主要在滩涂集群觅食长度2～10cm的鲻鱼类小鱼。黑脸琵鹭喜好在河口滩涂湿地栖息，特别是兼具广阔水产养殖池塘的区域，休息时常选择养殖池塘裸露土质堤坝的背风坡面作为停留地，与其混群栖息的苍鹭对人为干扰更为警觉，时常充当警卫角色。保护和可持续利用兴化湾湿地对黑脸琵鹭具有十分重要的意义。