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目前,戊型肝炎病毒HEV不仅发生于亚洲、非洲和拉丁美洲等许多发展中国家。
在许多发达国家本土也存在HEV感染。世界大部分学者研究证实人源HEV与猪源HEV病毒在基因水平上比较接近,而且猪源HEV可以实验性跨种间感染大猩猩和恒河猴等非人灵长类动物,同时在日本等地也发现多起因生食或半生食猪肉制品发生人员感染的病例。因此,猪源HEV的传播和流行已成为全球广泛关注的公共卫生问题。
2001年本课题组对采自吉林省某养殖场猪粪便进行RT - Nest - PCR检测,发现一阳性样品,对其ORF2部分基因序列进行分析,结果表明该分离株为HEV基因W型,命名为Ch一S一1。为进一步明确该猪源HEV基因特性,本研究设计8对PCR引物,分片段扩增Ch一S一I全基因,对两末端分别采用末端快速扩增方法(RACE)进行扩增,扩增产物克隆到pMD18一T载体上并进行序列测定。对所获全基因序列采用Clus-terX1. 81软件进行序列比对,采用PHYLIP WIN2.0软件绘制基因进化拓扑结构,在全基因序列的基础上比较猪源HEV与其他HEV基因型的差异。