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白干湖金矿处于康古尔塔格-黄山断裂构造带南侧苦水断裂与雅满苏断裂构成的楔形区内.矿体主要为石英脉型,其形态、产状、规模严格受脆韧性剪切带控制.含矿围岩为脆性变形的石英钠长斑岩、韧性变形的片理化灰岩和凝灰岩.与金矿化有关的围岩蚀变主要有硅化、碳酸盐化、绢云母化等.属与脆韧性剪切带和浅成石英钠长斑岩有关的中低温石英脉型金矿床.