【摘 要】
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WHIM指数是基于原子坐标的主成分分析(PCA)的,是一个对旋转和平移的不变量,因此不需要迭合程序。首先将一个加权方案应用到分子坐标,然后坐标中心化后计算加权协方差矩阵,用
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WHIM指数是基于原子坐标的主成分分析(PCA)的,是一个对旋转和平移的不变量,因此不需要迭合程序。首先将一个加权方案应用到分子坐标,然后坐标中心化后计算加权协方差矩阵,用该协方差矩阵作为主成分分析的基础,最后,用该协方差矩阵的得分矩阵提取统计参数,进而得到WHIM指数。因为坐标被中心化,所以产生的描述子对平移是一个不变量:主成分分析步骤给出了唯一对旋转为不变量的解。所以,一个数据集的WHIM指数是不受数据集中化合物的相对定位影响的。本文介绍了卤代脂醚对犁形四膜虫毒性的WHIM指数建模研究。
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