Modeling Cell Re-programming During Induced Pluripotency

来源 :第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:onepieceeee
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  Somatic cells can be reprogrammed to embryonic stem cell-like state by introducing few reprogramming factors.Inspired by the phenomenological reprogramming model of Artyomov et al.(2010), we proposed a novel Markov model with more realistic gene regulation rules and explored various properties of the model with Monte Carlo simulation.Furthermore, we demonstrated the utility of our model by testing it with the real dynamic gene expression data spanning across different intermediate stages in the iPSC reprogramming process.The data can be predicted and explained by our model reasonably well ; in turn, it lands further support on our general rules of gene regulation in iPSC reprogramming .
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