玉米耐盐性状的全基因组关联分析

来源 :江苏省遗传学会2016年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yalaso_wind
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  本研究利用高密度的SNP 芯片对150 份玉米自交系进行基因鉴定,结合基因型数据对耐盐主效QTL 进行全基因组关联分析(GWAS)来检测与耐盐相关的显著位点。从56110 个SNP 标记中筛选出分布于10 条染色体上34972 个具有高质量和多态性的SNP标记,采用TASSEL 中的GLM 算法对与耐盐相关的五个指标进行了关联分析,使用严格的LOD 阈值,分别检测到了与株高变化率、枯萎度、鲜重变化率、干重变化率、综合指标显著关联的46 个SNP 位点,且这些标记分布于除10 号染色体的所有染色体上。
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