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农超对接是农产品在我国的新型流通模式，构建适用于农超对接物流系统的绩效评价体系，找出关键性影响因素，可以为提高和改善农超对接物流系统指引方向。在构建评价体系的过程中，先从组成实体、内部物流流程运作和外部环境建立农超对接物流系统结构模型，然后根据系统结构模型的特点，从系统内部结构、运作效果及外部环境三个角度出发，建立了3级共24个指标的绩效评价体系，最后采用专家评分法及AHP层次分析法对福建省农超对接物流系统进行实例验证，利用ABC分类原则找出物流利润率、农产品安全度、系统纵向组织化程度、农产品保鲜水平及信息准确率是影响福建省农超对接物流的关键性因素，并针对这些关键影响因素提出改进农产品物流系统的建议。